Listado de Especies Parita Bay

Diego J. Lizcano

8/5/23

BirdNet Analyzer GUI (Usado por Carrie).

BirdNet

Windows GUI con Modelo predefinido (BirdNET_GLOBAL_2K_V2.1.)

Ofrece Ajuste de coordenadas y semanas.

BirdNet Analyzer Codigo

Reticulate

Phython desde el paquete reticulate: Mas control sobre los modelos, las semanas y automatización.

Los Modelos

  • BirdNET_6K_GLOBAL_MODEL: 6 mil especies globales. Año 2021. Usa Tensor Flow Lite. (393 sp en Parita)

  • BirdNET_GLOBAL_3K_V2.2_Model. Selection of 3,337 species >ia Norte America y algúnas globales. Año 2022. (363 sp en Parita)

  • V2.1 Extended 2022 training data. Global selection of 2,434 species. El que usa el Windows GUI (336 sp en parita)

  • V2.0, V1.4, V1.3, V1.2, V1.1 based on Wide-ResNet (“Phone App model”). 2021. 1,133 species >ia North America and Europe https://birdnet.cornell.edu/api/

Discusion de Modelos y clasificadores

BirdNET-Analyzer and new models online!

BirdNET Pi: some theory on classification & some practical hints

Lauha et al. 2022. Domain-specific neural networks improve automated bird sound recognition already with small amount of local data. MEE

Funcionamiento

Toma un minuto de grabacion y lo divide en 20 pedazos de 3 segundos. Limitación de no overlap, puede duplicar el tiempo.

Con BirdNET_GLOBAL_3K_V2.2_Model cada minuto de grabacion tarda 1.8 a 2.7 segundos en ser analizado.

Con BirdNET_6K_GLOBAL_MODEL cada minuto de grabacion tarda 2 a 2.9 segundos en ser analizado.

Codigo

Tiempos

Analizar una grabadora completa (6 a 7 mil grabaciones) con Con BirdNET_GLOBAL_3K_V2.2_Model toma de 4.5 a 6 horas en PC 4 procesadores de 2.7 GHz

Analizar una grabadora completa (6 a 7 mil grabaciones) con Con BirdNET_6K_GLOBAL_MODEL toma de 5 a 7 horas en PC 4 procesadores de 2.7 GHz. No permite paralelizacion?

Resultado

Resultado

  • Sin ningun filtro de confidence (0-1) hay mas de 300 especies. La mayoria son falsos positivos.

  • intentos de verificación con el paquete warbleR, abortado!

  • Verificación en Raven para establecer umbrales por especie con regresión logistica. Sugerencia de Carrie. 48 especies con umbral

Decisiones acordadas en abril